Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psmd9Q9CR00 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psmd9Q9CR00 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmd9Q9CR00 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmd9Q9CR00 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd9Q9CR00 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmd9Q9CR00 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms