Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smim8Q9CQQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smim8Q9CQQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smim8Q9CQQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms