Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufb5Q9CQH3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufb5Q9CQH3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 695.5 ms