Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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