Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe41Q99PV5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Bhlhe41Q99PV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms