Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cntnap4Q99P47 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntnap4Q99P47 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cntnap4Q99P47 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntnap4Q99P47 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms