Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gtf2ird2Q99NI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf2ird2Q99NI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf2ird2Q99NI3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms