Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Rnf17Q99MV7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Rnf17Q99MV7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rnf17Q99MV7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rnf17Q99MV7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rnf17Q99MV7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms