Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SrrtQ99MR6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrrtQ99MR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrrtQ99MR6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SrrtQ99MR6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms