Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tm2d1Q99MB3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tm2d1Q99MB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tm2d1Q99MB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms