Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PtprtQ99M80 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PtprtQ99M80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PtprtQ99M80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PtprtQ99M80 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PtprtQ99M80 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
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