Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gins4Q99LZ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gins4Q99LZ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gins4Q99LZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms