Protein–RNA interactions for Protein: Q99LP6

Grpel1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel1Q99LP6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grpel1Q99LP6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grpel1Q99LP6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grpel1Q99LP6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grpel1Q99LP6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms