Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Smtnl1Q99LM3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smtnl1Q99LM3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smtnl1Q99LM3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms