Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk5rap3Q99LM2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk5rap3Q99LM2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms