Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cmtm3Q99LJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cmtm3Q99LJ5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cmtm3Q99LJ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms