Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SmagpQ99KC7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SmagpQ99KC7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SmagpQ99KC7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms