Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdxdc1Q99K01 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdxdc1Q99K01 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdxdc1Q99K01 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pdxdc1Q99K01 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdxdc1Q99K01 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdxdc1Q99K01 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdxdc1Q99K01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms