Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf3Q922U1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf3Q922U1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prpf3Q922U1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prpf3Q922U1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms