Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ5

Pqbp1, Polyglutamine-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pqbp1Q91VJ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pqbp1Q91VJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pqbp1Q91VJ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pqbp1Q91VJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pqbp1Q91VJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pqbp1Q91VJ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pqbp1Q91VJ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pqbp1Q91VJ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pqbp1Q91VJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Pqbp1Q91VJ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pqbp1Q91VJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms