Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt79Q8VED5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt79Q8VED5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt79Q8VED5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt79Q8VED5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms