Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ApobrQ8VBT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ApobrQ8VBT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ApobrQ8VBT6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ApobrQ8VBT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ApobrQ8VBT6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.2 ms