Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cdk5rap2Q8K389 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cdk5rap2Q8K389 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cdk5rap2Q8K389 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cdk5rap2Q8K389 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cdk5rap2Q8K389 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cdk5rap2Q8K389 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdk5rap2Q8K389 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdk5rap2Q8K389 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms