Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssh3Q8K330 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssh3Q8K330 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssh3Q8K330 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms