Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sde2Q8K1J5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sde2Q8K1J5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sde2Q8K1J5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sde2Q8K1J5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms