Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FgbQ8K0E8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FgbQ8K0E8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FgbQ8K0E8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms