Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cpne5Q8JZW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpne5Q8JZW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne5Q8JZW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms