Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ClasrpQ8CFC7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ClasrpQ8CFC7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ClasrpQ8CFC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClasrpQ8CFC7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClasrpQ8CFC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ClasrpQ8CFC7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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