Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc28aQ8CEI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc28aQ8CEI3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms