Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc27Q8CD92 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc27Q8CD92 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ttc27Q8CD92 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc27Q8CD92 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms