Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf20l1Q8CCJ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Phf20l1Q8CCJ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Phf20l1Q8CCJ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms