Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q8CC96 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q8CC96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q8CC96 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CC96 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CC96 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CC96 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q8CC96 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CC96 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CC96 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CC96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8CC96 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8CC96 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8CC96 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CC96 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CC96 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CC96 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CC96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8CC96 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CC96 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CC96 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CC96 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CC96 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CC96 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CC96 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8CC96 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8CC96 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8CC96 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8CC96 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CC96 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8CC96 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8CC96 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8CC96 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8CC96 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8CC96 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8CC96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8CC96 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8CC96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q8CC96 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms