Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Parp9Q8CAS9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Parp9Q8CAS9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Parp9Q8CAS9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Parp9Q8CAS9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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