Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tsr2Q8C8T8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsr2Q8C8T8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr2Q8C8T8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsr2Q8C8T8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms