Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aph1bQ8C7N7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aph1bQ8C7N7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aph1bQ8C7N7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms