Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ubqln3Q8C5U9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Ubqln3Q8C5U9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ubqln3Q8C5U9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Ubqln3Q8C5U9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Ubqln3Q8C5U9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubqln3Q8C5U9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ubqln3Q8C5U9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubqln3Q8C5U9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Ubqln3Q8C5U9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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