Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sfrp1Q8C4U3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sfrp1Q8C4U3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms