Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Defa22Q8C1N8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa22Q8C1N8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa22Q8C1N8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms