Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn17Q8BXA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn17Q8BXA6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn17Q8BXA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn17Q8BXA6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms