Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nlrp4aQ8BU40 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nlrp4aQ8BU40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nlrp4aQ8BU40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms