Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Snapc4Q8BP86 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snapc4Q8BP86 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Snapc4Q8BP86 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snapc4Q8BP86 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snapc4Q8BP86 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms