Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop53Q8BK35 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop53Q8BK35 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nop53Q8BK35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nop53Q8BK35 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms