Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rufy1Q8BIJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rufy1Q8BIJ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rufy1Q8BIJ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy1Q8BIJ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms