Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cyp4f39Q8BGU0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cyp4f39Q8BGU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms