Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AW551984Q8BGF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AW551984Q8BGF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AW551984Q8BGF0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms