Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Susd6Q8BGE4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd6Q8BGE4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd6Q8BGE4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms