Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrtm2Q8BGA3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrtm2Q8BGA3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrrtm2Q8BGA3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms