Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW4

Trim65, Tripartite motif-containing protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim65Q8BFW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim65Q8BFW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim65Q8BFW4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim65Q8BFW4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim65Q8BFW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.8 ms