Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Srgap3Q812A2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Srgap3Q812A2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Srgap3Q812A2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Srgap3Q812A2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms