Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg4cQ811C2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg4cQ811C2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg4cQ811C2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms